La aplicación del Método Clínico en la enseñanza de las asignaturas Morfofisiología III y Medicina General Integral II en la carrera de Medicina, tiene especial  vigencia  en  correspondencia  con  las transformaciones  que se acontecen  en  la  educación  médica. Se realizó un estudio descriptivo, de corte transversal con enfoque cualitativo en la Facultad de Medicina de la Universidad de Ciencias Médicas de Villa Clara en el período comprendido de enero a octubre del 2015, en la temática del proceso de enseñanza aprendizaje de los estudiantes de primer año de la carrera de medicina con el propósito de elaborar una estrategia didáctica, para rescatar la aplicación del Método Clínico en la carrera Medicina. El diagnóstico exploratorio realizado durante el proceso de investigación permitió constatar la necesidad de fomentar el trabajo didáctico metodológico para potenciar la aplicación del Método Clínico en la enseñanza de las asignaturas Morfofisiología III y Medicina General Integral II. El sistema de acciones fue concebido de forma sistémica, ofreciéndose recomendaciones metodológicas para viabilizar su implementación.